Ett internationellt team av forskare som katalogiserade generna av mikrober som lever i vår tarmen har fastställt att på 3,3 miljoner, de överträffar de 23 000 eller så generna i det mänskliga genomet och säger att de hoppas katalogen hjälper oss att bättre förstå hur man behåller En hälsosam balans i vår tarmflora samt förbättra diagnos och behandling av sjukdom.

Du kan läsa ett vetenskapligt dokument om detta i den 4 mars online-utgåvan av Natur . Studien koordinerades av Dr Dusko Ehrlich vid Institut National de la Recherche Agronomique i Frankrike och är den gemensamma ansträngningen för forskare som arbetar med ett europeiskt projekt som heter MetaHIT (Metagenomics of the Human Intestinal Tract) i samarbete med Dr Jun Wang och kollegor Vid Beijing Genomics Institute i Shenzhen, Kina.

Escherichia coli , en av

Många arter av bakterier finns i

Den mänskliga tarmkanalen.

Tarmflora är avgörande för människors hälsa. Dubbat "mikrobiomen", det består av tusentals bakterier, svampar och andra mikrober som bryter ner toxiner, gör vitaminer och essentiella aminosyror och skapar en barriär mot invaderare.

För att få en omfattande bild av mångfalden av gener närvarande i tarmfloran, använde forskarna en metagenomisk metod där du tar prov från den miljö du vill studera och sekvenserar de gener de innehåller. Utmaningen är hur man gör det snabbt när man arbetar med miljontals gener.

En av de forskningscentra som arbetar med MetaHIT-projektet är European Molecular Biology Laboratory (EMBL) i Heidelberg, Tyskland. De berättade för pressen att detta är första gången som en metagenomikstudie har använt en genomströmningsmetod som heter Illumina, som andra trodde inte skulle vara genomförbara.

Processen innefattar att ta massor och många korta band av DNA, montera dem i större sektioner och sedan jämföra dem med kända sekvenser som lagras i referensdatabaser och utesluta de som är kända för att tillhöra det mänskliga genomet.

För denna studie använde forskarna fekalprover från 124 européer. Några av givarna var friska, andra var överviktiga eller överviktiga och vissa hade inflammatorisk tarmsjukdom.

Genom att uppskatta den genomsnittliga bakteriegenomstorleken förutspådde forskarna att de 3,3 miljoner tarmfloragenerna de räknade representerar förmodligen cirka 1 000 mikroberarter som bor i alla deltagares tarmar.

Dr George Weinstock, en genetiker vid Washington University i St Louis, USA, berättade för NatureNews att:

"Detta är det mest kraftfulla mikroskopet som hittills har använts för att beskriva mikrobiella samhällen."

Studien har också avslöjat ett antal ledtrådar om hur bakterier lyckas överleva i den mänskliga tarmens ganska obehagliga miljö.

För de flesta bakterier är människans tarm inte ett bra ställe att vara: det har lågt pH (väldigt surt), knappt något syre och inget ljus. Det enda sättet att trivas här är att utvecklas, och denna studie har presenterat några intressanta ledtrådar om hur de gjorde det här.

Forskarna fann att varje enskild bakterie behöver vissa gener att överleva i människa, men det finns också andra gener som måste vara närvarande i vissa enskilda mikrober, men inte alla för att kolonin ska överleva.

Detta kan förklara en annan intressant upptäckt. Forskarna fann att även om enskilda deltagare i studien endast hade cirka 160 av de 1 000 möjliga arterna var cirka 40 procent av den ena deltagarens tarmflora också närvarande i omkring 50 procent av de övriga deltagarna.

Forskarna tror att en av de intressanta frågorna som bör undersökas är om dessa gemensamma gener kommer från samma eller från olika bakterier bland olika människor.

De hoppas också att deras gutflora genkatalog kommer att användas som referensresurs för att undersöka de genetiska länkarna mellan tarmbakterier och speciella sjukdomar och livsstilsmönster som kost.

Medförfattare Dr Peer Bork, seniorforskare och gemensam gruppledare för enheten för struktur och databehandling vid EMBL, berättade för media att:

"Att veta vilken kombination av gener som är nödvändig för den rätta balansen mellan mikrober för att trivas inom vår tarm kan tillåta oss att använda pallprover, som är icke-invasiva, som ett mått på hälsan."

"En dag kan vi till och med kunna behandla vissa hälsoproblem genom att bara äta en yoghurt med rätt bakterier i den", tillade han.

"En mikrobiell genkatalog för humant tarm etablerad genom metagenom sekvensering."

Junjie Qin, Ruiqiang Li, Jeroen Raes, Manimozhiyan Arumugam, Kristoffer Solvsten Burgdorf, Chaysavanh Manichanh, Trine Nielsen, Nicolas Pons, Florens Levenez, Takuji Yamada, et al.

Natur , 464, 59-65 (4 mars 2010)

DOI: 10.1038 / nature08821

Källor: European Molecular Biology Laboratory, NatureNews.

Forskning: Förändrad tarmflora kan orsaka diabetes (Video Medicinsk Och Professionell 2025).